Programa de Pós-Graduação em Agronomia

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Navegando Programa de Pós-Graduação em Agronomia por Autor "Abe, Valeria Yukari"

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    Caracterização estrutural e polimorfismo de genes candidatos à efetores de Phakopsora pachyrhizi
    (Universidade Estadual do Norte do Paraná, 2017-03-30) Castanho, Fernanda Machado; Carvalho, Mayra Costa da Cruz Gallo de; https://orcid.org/0000-0002-1559-3828; http://lattes.cnpq.br/2844751503530944; Carvalho, Mayra Costa da Cruz Gallo de; https://orcid.org/0000-0002-1559-3828; http://lattes.cnpq.br/2844751503530944; Zawadzki, Aline Vanessa Sauer; https://orcid.org/0000-0003-3164-9710; Abe, Valeria Yukari; https://orcid.org/0009-0005-3231-6928; http://lattes.cnpq.br/8080855435804141; Carvalho, Sandremir de; http://lattes.cnpq.br/8684697240694261; Matsumoto, Leopoldo Sussumu; https://orcid.org/0000-0001-5102-545X; http://lattes.cnpq.br/0857955043436449
    O fungo biotrófico obrigatório Phakopsora pachyrhizi Syd. e P. Syd. é o agente causador daferrugem asiática da soja (FAS), uma das principais doenças que acomete a cultura da soja(Glycine max). Embora já tenham sido descritos locus de resistência à ferrugem asiática ou Rpp(Resistence to Phakopsora pachyrhizi), ainda não existe cultivares de soja completamenteresistentes à grande diversidade de raças patogênicas do fungo P. pachyrhizi. Durante oprocesso de infecção, o fungo secreta pequenas proteínas ou SSP (Small Secreted Protein) quepodem agir como efetores de virulência (vr) quando o hospedeiro for suscetível ou avirulência(Avr) quando o hospedeiro for resistente. O processo de coevolução entre a soja e o fungo fazcom que as interações Avr-R permaneçam sob constante pressão de seleção. Assim, constataro nível de variação genética em genes candidatos a efetores de P. pachyrhizi poderá permitir acompreensão do processo de seleção atuante, além de auxiliar na identificação dos domínioschave no reconhecimento R-Avr. Recentemente, 13 famílias ou tribos gênicas, enriquecidas emcandidatos à efetores de P. pachyrhizi foram identificadas, e destas, as famílias 1, 2 e 3 forameleitas como principais. No presente trabalho, a estrutura molecular, a variabilidade genética ea filogenia de sete genes candidatos à efetores, distribuídos nas famílias 1 e 3, foram avaliadas.Com o objetivo de observar possíveis padrões de evolução dos polimorfimos e mecanismos deseleção, três isolados do fungo (FTPY15.1M, LDA13.2M e L.PF02B07) produzidos a partir demateriais coletados em diferentes anos e regiões geográficas foram utilizados. Em geral, todosos candidatos avaliados possuem características comuns à outros efetores descritos na literatura:tamanho reduzido, presença de peptídeo sinal de secreção, motivos conservados e resíduos decisteína. Os candidatos pertencentes à família 1 apresentaram maiores índices de polimorfismoscom total de 160 SNPs e 8 substituições não sinônimas comparado com os candidatos da família3 com 48 e 1, respectivamente. Os candidatos da família 1 também apresentaram maiordiversidade filogenética, sendo o 5849 o único capaz de separar os isolados do mesmo efetorem dois clusters e o que também demonstrou resultado significativo para seleção positiva,juntamente com o 2238, ambos com ênfase nos motivos RCR conservados encontrados,sugerindo que estes genes possam realmente atuar como efetor e ainda este motivo ter umimportante papel no reconhecimento pelos genes R.